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2020年3月4日,美国疾控中心等机构的研究人员在bioRxiv上发表论文,描述了从第一个美国新冠肺炎患者体内分离出的病毒,并描述了其基因组序列和复制特性。
研究人员表示,此次疫情传播速度之快前所未有,迫切需要为进一步研究新冠病毒提供参考试剂。
公共卫生界也需要病毒裂解物作为诊断参考,而研究界需要病毒分离物测试抗病毒化合物、开发新疫苗和进行基础研究。
(注意:预印本网站bioRxiv所有论文未经同行评议)
自新冠肺炎疫情暴发以来,美国第一例患者于1月20日被华盛顿州和美国疾控中心确诊。
研究人员从该患者鼻咽(NP)和口咽(OP)标本中分离出病毒,并对病毒序列、复制特性和细胞培养向性进行了表征。
研究人员于1月22日将阳性标本重新制作和冷冻,然后接种到细胞培养皿中。
2天后,研究人员观察到细胞病变效应(CPE),并在3天后收集到病毒裂解液。
50μl首次提取的病毒裂解物被用于新冠病毒核酸测试,能检测新冠病毒的离析。
研究人员还用检测了提取物中是否存在另外33种不同的呼吸道病毒和细菌病原体,未发现其他病原体。
此外,薄切片电子显微镜也支持鉴定。研究人员还观察了冠状病毒的形态和形态发生特征。
接种后3天vero单分子层图像
研究人员测序了从第一代OP和NP标本中分离出的病毒,结果显示完全匹配。
并且,研究人员在没有胰蛋白酶的情况下传代了这种病毒。
而且,在缺乏胰蛋白酶的情况下,新冠病毒在VeroCCL81细胞和Vero E6细胞中复制到高滴度。
研究人员在VeroE6细胞(另一种恒河猴胎儿肾脏细胞系)上产生了第四代新冠病毒。
RNA测序显示,其与原始序列相比无核苷酸突变。
SARS-CoV和MERS-CoV也分别在VeroE6和VeroCCL81细胞上生长良好。
经过一系列的稀释感染后,研究人员还发现新冠病毒在两种Vero细胞中都有复制,然而,VeroE6细胞的病毒滴度略高于Vero CCL81。
此外,斑块在Vero E6上更加清晰可见(如图)。
早在接种后2天,VeroE6细胞就产生了明显的斑块,并可见中性红染色。
相比之下,Vero CCL81产生的斑块较少。
研究人员已将病毒分离物存入两个病毒试剂库,BEI资源和世界新兴病毒和虫媒病毒参考中心,以便公众卫生和研究界能够广泛获得该病毒及相关信息。
相关论文信息:https://doi.org/10.1101/2020.03.02.972935
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